В год 1999, человек по имени Томас Андерсон (также известный как Нео), жил обычной неприметной жизнью. Простой разбработчик программного обеспечения днем и компьютерный хакер ночью - сидит сам один в темной комнате перед монитором, ждет знака..
Знака, которого он даже не знает и вот однажды ночью, таинственная женщина по имени Тринити находит его и знакомит с безликим персонажем, которого Томас так долго ждал, он знакомится с Морфеем. В некотором роде это мессия, показывающий Нео всю правду о жизни вокруг, о темных секретах, спрятанных внутри и о его миссии, предназначеной судьбой.